El Instituto de Investigaciones Feministas colabora con Institutos de Género, Cátedras de Género y Unidades de Igualdad de las Universidades de todo el territorio español. Desde su fundación el Instituto de Investigaciones Feministas mantiene una relación y obtiene subvención para sus proyectos del Instituto de la Mujer; la Dirección General de Igualdad de Oportunidades del Ayuntamiento de Madrid; la Dirección General de la Mujer de la Comunidad de Madrid y el Ministerio de Educación, Cultura y Deporte. Asimismo, realiza actividades en colaboración con instituciones culturales de Madrid, como el Círculo de Bellas Artes de Madrid, Ateneo de Madrid, el Museo del Prado, el Museo Arqueológico Nacional, el Centro de Arte Reina Sofía, el Museo del Traje o el Museo del Romanticismo.

Actualmente el Instituto de Investigaciones Feministas colabora con distintas entidades tanto nacionales como internacionales relacionadas con los estudios de género y feminismo. Los convenios vigentes se han establecido con:

• Con centros universitarios nacionales como:
• Convenio con Universidad de Málaga- Firmado 21 septiembre 2022 (vigencia 4 años).
• Convenio con la UNED- Firmado 23 junio 2022 (vigencia 4 años).
• Convenio con la Universidad de Almería- Firmado 26 de julio 2022 (vigencia 4 años)

Mediante los programas de movilidad para la acogida de profesorado visitante con las siguientes instituciones:

• Universidad de Tours (Francia)
• Universidad de Calabria (Italia)
• Universidad Veracruzana (Jalapa, México)
• Universidad de Chile
• Universidad de Los Andes (Colombia)
• Universidad do Porto (Portugal)
• Universidad Autónoma del Estado de México (México)
• CONICET (Argentina)
• Universidad de Zadar (Croacia)
• Universidad Autónoma Metropolitana (México)
• Universidad Nacional de Colombia
• Universidad de Aveiro, Portugal
• En el pasado se han realizado convenios con centros universitarios internacionales como:
• University of Wisconsin, Madison (USA)
• Department of Spanish and Portuguese del College of Letters and Sciencies de Northwestern University, Chicago (USA).
• Universidad Técnica de Manabí, Ecuador en el 2016.
• Universidad de Coimbra (Portugal), Convenio Bilateral Erasmus firmado en el curso 2012-13 y prorrogado a 2014-15.
• Universidad Christian Albrects Úniversitat (Kiel, Alemania), convenio Bilateral Erasmus firmado en el curso 2014-15 y prorrogado 2015-16.
• Universidad de Wrigth State University de Ohio, firmado en el curso 2014- 2015.
• Universidad de Puebla (México), firmado en el curso 2014-15.
• Con centros de formación especializada como Real Escuela Superior de Arte Dramático (RESAD)
• Con asociaciones científicas como las siguientes:
• Asociación de Mujeres en las Artes Visuales (MAV). Del curso 2014-15 al 2017-18.
• Mujeres Cineastas y de Medios Audiovisuales (CIMA).
• Asociación Española de Investigación en Historia de las Mujeres.
• Plataforma de Institutos Universitarios de Investigación en feminismo y género (Universidades madrileñas y españolas, Observatorios de género, centros de investigación en género del Centro Superior de Investigaciones Científicas).
• Asociación de Mujeres Investigadoras y Tecnólogas (AMIT).
• Red transversal en Estudios de Género en Ciencias Humanas, Sociales y Jurídicas impulsada desde el Centro de Ciencias sociales, Humanas y Jurídicas del CSIC (Centro Superior de Investigaciones Científicas). Propicia la colaboración entre especialistas de más de 40 instituciones nacionales e internacionales.
• Forum de Psicoterapia Psicoanalítica, www.psicoterapiapsicoanalítica.com;
• The European Association for Gender Research, Education and Documentation, ATGENDER. Es una red académica que tiene como principales objetivos establecer una asociación europea de personas e instituciones vinculadas a los estudios de género, a fin conseguir difundir los conocimientos desarrollados en los distintos centros de investigación, trabajar por la institucionalización de este tipo de estudios, facilitar la colaboración entre los organismos de investigación y las asociaciones que forman el tejido social, y apoyar el trabajo de los y las jóvenes investigadoras en género facilitando los intercambios en Europa.
• Con asociaciones sociales:
• Asociación Clásicas y Modernas (Asociación para la Igualdad de Género en la Cultura) desde 2014 hasta la actualidad.
• Asociación de Mujeres Gitanas Alboreá, desde 2017.
• Asociación Cooperación e Intercambio Madrid y el Mundo Convenio (ACIMEN) para la realización de un campamento de verano por la igualdad de género, con talleres de refuerzo y otras actividades culturales. Desde el 27-06-2016 hasta 29-07-2016.
• Comunidad de Madrid, a través de la Consejería de Políticas sociales y Familia para la impartición de un Título de Posgrado universitario en igualdad de oportunidades entre mujeres y hombres cofinanciado por el FSE en el P.O. 2014-2020 de la Comunidad de Madrid. Duración: junio 2018–marzo 2020.