Nuestra compañera, Candela Hernández, impartirá una actividad formativa en el marco de la Escuela de Doctorado, en su cuarta edición: "Taller avanzado de bioinformática y análisis de datos ómicos en R". En un taller en modalidad online síncrona que tendrá lugar del 16 al 20 de marzo.

Objetivos

Esta actividad formativa se dirige a profundizar en el análisis de datos ómicos usando el entorno R, abordando aspectos concretos que requieren un mayor conocimiento respecto al lenguaje de programación y a la naturaleza misma de este big data. La perspectiva ómica –uso de datos biológicos de alta resolución, en sus diferentes vertientes, genómica, transcriptómica, etc.– comienza a ser hoy en día imprescindible no solo para la investigación básica sino también en su traslación al ámbito clínico y biomédico. En este contexto, surgen numerosos desafíos en cuanto a la descarga, extracción, modificación, organización y análisis de estos datos masivos, cuyo abordaje requiere el uso de herramientas y metodologías específicas. Todo ello justifica que en la actualidad exista una gran demanda de perfiles profesionales dedicados a estas tareas bioinformáticas. Algunos de los enfoques presentados en esta actividad se centran en aspectos de modelización e integración de variantes genéticas (genotipos) y manifestaciones clínicas (fenotipos), eje de gran potencialidad en el marco del diagnóstico y tratamiento de enfermedades y para estrategias futuras de relevancia, como la medicina personalizada y los enfoques terapéuticos individualizados.

La presente actividad pretende ser de interés para los estudiantes de diferentes Programas de Doctorado de Ciencias y Ciencias de la Salud.

Contenidos

• Análisis exploratorios de datos genómicos.
• Genómica computacional.
• Métodos de aprendizaje automático (machine learning) aplicados a datos de naturaleza ómica. Algoritmos y construcción de modelos predictivos.
• Trabajo con intervalos genómicos
• Análisis de integración de datos multi-ómicos y fenotípicos (clínicos).
• Programación eficiente con R y RStudio. Flujos de trabajo orientados a proyectos e investigación reproducible

Programa

• Sesión 1. Día 16 de marzo de 10:30 a 12:30  Análisis de datos (gen)ómicos masivos. Estudio de asociación de genoma completo.
• Sesión 2. Día 17 de marzo de 10:30 a 12:30. Intervalos genómicos y herramientas de visualización.
• Sesión 3. Día 18 de marzo de 10:30 a 12:30. Aprendizaje automático en R.
• Sesión 4. Día 19 de marzo de 10:30 a 12:30. Análisis multi-ómicos. Trabajo con datos de biobancos.
• Sesión 5. Día 20 de marzo de 10:30 a 14:30. Investigación reproducible en RStudio y programación eficiente

  20 plazas disponibles. Toda la información en el siguiente enlace.