El SIIU está dividido en diferentes áreas y en cada una de ellas se dispone de variables e indicadores que permiten realizar un análisis exhaustivo de las diversas dimensiones del sistema universitario. La información disponible es la siguiente:

• Área auxiliar. Las universidades, públicas y privadas, con sus centros, unidades y estudios impartidos.
• Área académica. Los estudiantes con sus características curriculares, sociales y demográficas. Los procesos de PAU y preinscripción.
• Área de recursos humanos. El personal docente e investigador (PDI) y el personal de administración y servicios (PAS) con sus características profesionales, sociales y demográficas.

• Área económica. Las cuentas anuales de las universidades: sus liquidaciones presupuestarias y los indicadores financieros.
• Área de becas y ayudas al estudio. Las becas concedidas por el Estado, las comunidades autónomas y las universidades, así como información curricular y sociodemográfica de sus beneficiarios.
• Área de I+D. La actividad investigadora e innovadora de las universidades españolas.
• Área de inserción laboral. La entrada y el mantenimiento de los egresados universitarios en el mercado del trabajo.