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El museo de Anatomía de la Facultad de Medicina de la Universidad Complutense de Madrid surge en el seno del Real Colegio de Cirugía de San Carlos, creado por Real Cédula en 1787 por Carlos III, siendo su primer director Antonio de Gimbernat como director del Real Colegio y posteriormente Ignacio Lacaba, bajo cuya dirección se realizaron la mayor parte de las esculturas en cera policromada.
Alcanza su mayor esplendor como “Museo Anatómico”, bajo la dirección de Pedro González de Velasco (1857), siendo muchos los anatómicos que con posterioridad han contribuido al engrandecimiento del mismo (Julián Calleja, Federico Olóriz, Julián de la Villa, Pedro Ara, Daniel Mezquita, Gómez Oliveros, Orts Llorca). A pesar de ello, el museo entró en un estado de progresivo abandono que estuvo a punto de hacerlo desaparecer y así hubiera sido sin los denodados esfuerzos de su último director, el recientemente fallecido Profesor Puerta Fonollá.
El museo en la actualidad está constituido fundamentalmente por:
También se pueden apreciar representaciones en cartón piedra, diferentes tipos de láminas anatómicas, preparaciones momificadas o semiartificiales de regiones anatómicas y diferentes modelos anatómicos para el estudio del cuerpo humano.