Catedrático de Prima de Medicina en la Universidad de Alcalá de Henares desde finales del S. XVIII y socio de la Academia de Médicos de Madrid.
El doctor Pinilla logró reunir una extensa biblioteca con libros de Medicina renacentista y barroca, que legó a su muerte a la Universidad y de los que conservamos 165 ejemplares en la Biblioteca Histórica.
Escribió la "Carta consultatoria al Dr. D. Timoteo Oscalán sobre la inoculación de las viruelas", en la que se opone a la inoculación experimental de las viruelas fundándose en la autoridad de los teólogos, que conservamos en la BH y exponemos por lo controvertido y curioso del tema.